Archief van de Nederlandse predikant en auteur Nicolaas Beets (1814-1903) en zijn familie. Bevat personalia, correspondentie, manuscripten, preken, archivalia van Beets’ kinderen, en documentatie betreffende Beets en zijn werk. Tevens verzameling auteursexemplaren en overdrukken met werk van Beets.

Wetenschappelijk archief en gedrukte werken bijeengebracht door Gerardus Johannes Petrus Josephus Bolland (1854-1922), Leids hoogleraar Letteren en Wijsbegeerte (Geschiedenis der wijsbegeerte, logica, metaphysica en zielkunde) 1896-1922.

Archief van Johannes de Zwaan (1883-1957), hoogleraar godgeleerdheid in Groningen en Leiden, met persoonlijke stukken, correspondentie, wetenschappelijke aantekeningen en teksten van verhandelingen betreffende godgeleerdheid en dossiers over zijn politieke en maatschappelijke activiteiten.

Bibliotheek van Theodorus Groenhout (ca. 1640-1716), pastoor te Edam (1665), Limmen (1680) en Noordwijk (1691)

Archief van William Brede Kristensen (1867-1953), Leids hoogleraar godsdienstgeschiedenis, met persoonlijke stukken, correspondentie, wetenschappelijke aantekeningen en teksten van verhandelingen betreffende godgeleerdheid, en collegedictaten.

Archief van Abraham Kuenen (1828-1891), Leids hoogleraar godgeleerdheid en een van de leidende figuren van de moderne richting binnen de Nederlandse Hervormde Kerk, met correspondentie, collegedictaten en aantekeningen voor zijn eigen colleges, wetenschappelijke aantekeningen en teksten van verhandelingen en toespraken over godgeleerdheid (met name het Oude Testament).

Archief van de curatoren van het Legatum Stolpianum. Het archief (416 nummers) bestrijkt de periode 1753-2001 en bevat ingestuurde prijsantwoorden in handschrift, correspondentie, financiële administratie en varia.

Persoonlijk archief van Kornelis Heiko Miskotte (1894-1976), Leids hoogleraar godgeleerdheid vanwege de Nederlands Hervormde Kerk (dogmatiek, theologische ethiek, kerkrecht, zendingswetenschap) in de periode 1945-1959.

De bibliotheek van het Remonstrants Seminarie bevat ca. 5.000 drukken en ca. 220 handschriften verzameld ten behoeve van de predikantenopleiding van de Remonstrantse Broederschap.

Archief van Karel Hendrik Roessingh (1886-1925), Leids hoogleraar godgeleerdheid, met aantekeningen voor colleges, lezingen, toespraken en verhandelingen op het terrein van de godgeleerdheid.

Archief van Gerhard Sevenster (1895-1985), vanaf 1921 predikant en vanaf 1933 hoogleraar te Leiden. Het archief heeft betrekking op beide functies en bevat grotendeels preken, (college)dictaten en aantekeningen.